MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 1019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009377	GGAT	2	8	783	790	25 %	25 %	50 %	0 %	145597104
2	NC_009377	AGC	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597104
3	NC_009377	G	6	6	948	953	0 %	0 %	100 %	0 %	145597104
4	NC_009377	GGT	2	6	961	966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597104
5	NC_009377	ACTG	2	8	1010	1017	25 %	25 %	25 %	25 %	145597104
6	NC_009377	TCG	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597104
7	NC_009377	AAC	2	6	1250	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597105
8	NC_009377	A	6	6	1273	1278	100 %	0 %	0 %	0 %	145597105
9	NC_009377	TTCA	2	8	1303	1310	25 %	50 %	0 %	25 %	145597105
10	NC_009377	CAGA	2	8	1363	1370	50 %	0 %	25 %	25 %	145597105
11	NC_009377	AG	3	6	1391	1396	50 %	0 %	50 %	0 %	145597105
12	NC_009377	TGGC	2	8	1496	1503	0 %	25 %	50 %	25 %	145597106
13	NC_009377	GGCGA	2	10	1592	1601	20 %	0 %	60 %	20 %	145597106
14	NC_009377	ACC	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597107
15	NC_009377	CA	3	6	1757	1762	50 %	0 %	0 %	50 %	145597107
16	NC_009377	CGC	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597107
17	NC_009377	A	7	7	1815	1821	100 %	0 %	0 %	0 %	145597107
18	NC_009377	CG	3	6	1901	1906	0 %	0 %	50 %	50 %	145597107
19	NC_009377	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597107
20	NC_009377	TAC	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597107
21	NC_009377	TGCGC	2	10	2099	2108	0 %	20 %	40 %	40 %	145597107
22	NC_009377	TACC	2	8	2132	2139	25 %	25 %	0 %	50 %	145597107
23	NC_009377	GCA	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597107
24	NC_009377	AAC	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597107
25	NC_009377	GATG	2	8	2309	2316	25 %	25 %	50 %	0 %	145597107
26	NC_009377	GC	3	6	2406	2411	0 %	0 %	50 %	50 %	145597107
27	NC_009377	A	6	6	3779	3784	100 %	0 %	0 %	0 %	145597108
28	NC_009377	ACT	2	6	3786	3791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597108
29	NC_009377	TTA	2	6	3823	3828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597108
30	NC_009377	CAT	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597108
31	NC_009377	ACC	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597108
32	NC_009377	GGA	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
33	NC_009377	TC	3	6	5375	5380	0 %	50 %	0 %	50 %	145597109
34	NC_009377	AC	3	6	5451	5456	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
35	NC_009377	AGCCA	2	10	5530	5539	40 %	0 %	20 %	40 %	145597109
36	NC_009377	AGC	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
37	NC_009377	CATGG	2	10	5792	5801	20 %	20 %	40 %	20 %	145597109
38	NC_009377	AGG	2	6	5826	5831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
39	NC_009377	GATG	2	8	5842	5849	25 %	25 %	50 %	0 %	145597109
40	NC_009377	GTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597109
41	NC_009377	AC	3	6	5874	5879	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
42	NC_009377	GTA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
43	NC_009377	GTT	2	6	6059	6064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597109
44	NC_009377	AAC	2	6	6096	6101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597109
45	NC_009377	ATCCA	2	10	6303	6312	40 %	20 %	0 %	40 %	145597109
46	NC_009377	TCA	2	6	6354	6359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
47	NC_009377	CGA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
48	NC_009377	AAG	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597109
49	NC_009377	GCA	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
50	NC_009377	G	8	8	6601	6608	0 %	0 %	100 %	0 %	145597109
51	NC_009377	TGG	2	6	6633	6638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597109
52	NC_009377	G	6	6	6661	6666	0 %	0 %	100 %	0 %	145597109
53	NC_009377	ATC	2	6	6789	6794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
54	NC_009377	ATCG	2	8	6811	6818	25 %	25 %	25 %	25 %	145597109
55	NC_009377	AC	3	6	6860	6865	50 %	0 %	0 %	50 %	145597109
56	NC_009377	GC	3	6	6892	6897	0 %	0 %	50 %	50 %	145597109
57	NC_009377	GCA	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
58	NC_009377	CAG	4	12	7037	7048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
59	NC_009377	GAT	2	6	7192	7197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
60	NC_009377	GGC	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597109
61	NC_009377	AGG	2	6	7224	7229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597109
62	NC_009377	TGA	2	6	7243	7248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597109
63	NC_009377	ACT	2	6	7279	7284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597109
64	NC_009377	AG	3	6	7332	7337	50 %	0 %	50 %	0 %	145597109
65	NC_009377	GAC	2	6	7354	7359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597109
66	NC_009377	AAAT	2	8	7817	7824	75 %	25 %	0 %	0 %	145597110
67	NC_009377	AT	3	6	7910	7915	50 %	50 %	0 %	0 %	145597110
68	NC_009377	GGAT	2	8	7917	7924	25 %	25 %	50 %	0 %	145597110
69	NC_009377	ATT	2	6	7940	7945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597110
70	NC_009377	AATA	2	8	7993	8000	75 %	25 %	0 %	0 %	145597110
71	NC_009377	AATCTT	2	12	8011	8022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	145597110
72	NC_009377	A	6	6	8055	8060	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
73	NC_009377	TGG	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597110
74	NC_009377	A	7	7	8337	8343	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
75	NC_009377	GA	4	8	8353	8360	50 %	0 %	50 %	0 %	145597110
76	NC_009377	ATA	2	6	8384	8389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597110
77	NC_009377	A	6	6	8482	8487	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
78	NC_009377	TGT	2	6	8532	8537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597110
79	NC_009377	A	8	8	8542	8549	100 %	0 %	0 %	0 %	145597110
80	NC_009377	TTA	2	6	8966	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597111
81	NC_009377	ATT	2	6	8975	8980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597111
82	NC_009377	GTA	2	6	8993	8998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597111
83	NC_009377	TAG	2	6	9035	9040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597111
84	NC_009377	TGA	2	6	9269	9274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597112
85	NC_009377	GAA	2	6	9311	9316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597112
86	NC_009377	GCC	2	6	9342	9347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597112
87	NC_009377	TCTG	2	8	9542	9549	0 %	50 %	25 %	25 %	145597112
88	NC_009377	CAT	2	6	9606	9611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597112
89	NC_009377	GACC	2	8	9627	9634	25 %	0 %	25 %	50 %	145597112
90	NC_009377	CGTG	2	8	9761	9768	0 %	25 %	50 %	25 %	145597112
91	NC_009377	GCC	2	6	9789	9794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597112
92	NC_009377	TCCG	2	8	9850	9857	0 %	25 %	25 %	50 %	145597112
93	NC_009377	GTT	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597112
94	NC_009377	CTG	2	6	9933	9938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597113
95	NC_009377	CAGC	2	8	10016	10023	25 %	0 %	25 %	50 %	145597113
96	NC_009377	GCT	2	6	10031	10036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597113
97	NC_009377	GCA	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597114
98	NC_009377	AG	3	6	10400	10405	50 %	0 %	50 %	0 %	145597114
99	NC_009377	TGC	2	6	10439	10444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597114
100	NC_009377	AG	3	6	10491	10496	50 %	0 %	50 %	0 %	145597114
101	NC_009377	AAG	2	6	10555	10560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597114
102	NC_009377	AAT	2	6	10602	10607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597114
103	NC_009377	AAG	2	6	10616	10621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597114
104	NC_009377	ATC	2	6	10739	10744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597114
105	NC_009377	CATTCA	2	12	10746	10757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597114
106	NC_009377	CA	3	6	10846	10851	50 %	0 %	0 %	50 %	145597114
107	NC_009377	GC	4	8	10923	10930	0 %	0 %	50 %	50 %	145597114
108	NC_009377	CAG	2	6	10937	10942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597114
109	NC_009377	CAC	2	6	10949	10954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597114
110	NC_009377	TTAC	2	8	10994	11001	25 %	50 %	0 %	25 %	145597114
111	NC_009377	GCG	2	6	11008	11013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597114
112	NC_009377	ATT	2	6	11245	11250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597114
113	NC_009377	A	6	6	11368	11373	100 %	0 %	0 %	0 %	145597114
114	NC_009377	CAG	2	6	11470	11475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597114
115	NC_009377	ATGA	2	8	11601	11608	50 %	25 %	25 %	0 %	145597114
116	NC_009377	AGA	2	6	11633	11638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597114
117	NC_009377	TAT	2	6	11672	11677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597114
118	NC_009377	ATT	2	6	11738	11743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597114
119	NC_009377	ATA	2	6	12008	12013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597115
120	NC_009377	T	6	6	12058	12063	0 %	100 %	0 %	0 %	145597115
121	NC_009377	ATAA	2	8	12085	12092	75 %	25 %	0 %	0 %	145597115
122	NC_009377	GTC	2	6	12106	12111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597115
123	NC_009377	ACC	2	6	12270	12275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597116
124	NC_009377	TCCA	2	8	12289	12296	25 %	25 %	0 %	50 %	145597116
125	NC_009377	TTC	2	6	12352	12357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597116
126	NC_009377	TCT	2	6	12377	12382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597116
127	NC_009377	ACG	2	6	12407	12412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597116
128	NC_009377	TCTG	2	8	12509	12516	0 %	50 %	25 %	25 %	145597117
129	NC_009377	TTTGA	2	10	12534	12543	20 %	60 %	20 %	0 %	145597117
130	NC_009377	GTG	2	6	12555	12560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597117
131	NC_009377	TGC	2	6	12591	12596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597117
132	NC_009377	GAA	2	6	12687	12692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597117
133	NC_009377	CTT	2	6	12701	12706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597117
134	NC_009377	CTGA	2	8	12708	12715	25 %	25 %	25 %	25 %	145597117
135	NC_009377	TCA	2	6	12733	12738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597117
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264	NC_009377	TTAG	2	8	19931	19938	25 %	50 %	25 %	0 %	145597130
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